במצבי חולי מסויימים נוצרים נוגדנים בגוף כנגד חלבונים הקיימים בו, אחת הסיבות שיכולה להביא לכך הינה תהליך כימי שמשנה את מבנה המולקולות של החלבונים הבונים את הרקמה התקינה. לאחר שקורה שינוי זה, יכולת הגוף לזהות את החלבון המקורי העצמי אובדת. בדיקת ACPA הינו סמן ביולוגי מובהק בשינוי כזה ומסייע לאבחון דלקת מפרקים שגרונתית.